对段祺瑞进行嘉奖，这一次是加封他为三等世袭武毅子爵，虽然爵位并没有什么实权，但也是极高的荣誉，由其还是世袭爵位，这也就意味着段祺瑞的子孙也能继承他的爵位，因此这绝对可以算是光宗耀祖。
另外清廷在给段祺瑞的制词当中，也对他多有称赞，甚致将段祺瑞比作曾国藩，最后要求段祺瑞立刻进军，攻占归德府，彻底清剿匪贼。原来段祺瑞收复了大名府之后，除了部份满族权贵之外，其他的大臣们，都对段祺瑞十分赞赏，而且认为这次进剿的成功在望，由其是英法日俄等国的公使，希望清廷能够下令段祺瑞，一鼓作气攻取归德府，彻底平定河南的匪乱，当然可以牵制华东政府的精力。
而慈禧也认为如果能够尽快平定河南的匪乱当然是好事，一来可以提升朝廷的威信力；二来也可以给海外华人一个教训；三来则是可以借机提拔段祺瑞，分化袁世凯的势力。因此才再次嘉奖段祺瑞。
段祺瑞当然不知道这里面错综复杂的事情，但对他这样平民出身的人，能够得到朝廷这样的恩典，确实是祖坟上冒青烟，更是对朝廷感恩戴德，因此也下定决心，一定要打到归德府去，以报效朝廷。而就在这时，袁世凯的回信也送到了段祺瑞的手里。
接到袁世凯的信时，段祺瑞的心里也有些忐忑不安，生怕袁世凯在信中大骂自己一顿，不过打开信一看，袁世凯首先恭贺段祺瑞升官，并且还送上了1万两白银的贺仪，都送到段祺瑞家里，而对袁世凯先前的什么保存实力，不可进军之类要求则支字未提，只是委婉的向段祺瑞提出警告，木秀于林，风必摧之，并希望段祺瑞好自为之。
看完信之后，段祺瑞心里到是松了一口气，至少袁世凯没有挑明和自己翻脸，只是十分委婉的提了一下，而段祺瑞往深里一想，认为这也并不奇怪，因为进军是朝廷下的令，而袁世凯没有能让自己应付朝廷的办法，只好作罢，而且自己现在己是巡抚，袁世凯也不能不给自己几分面子，现在袁世凯和自己翻脸有什么好处呢？而且以后袁世凯显然还有用得到自己的地方，不如留一线，日后也好见面。
想到了这里，段祺瑞的心里也对袁世凯有几分歉意，毕竟这次出战自己没有按照袁世凯的吩咐去做，显然是对不起袁世凯对自己的知遇之恩，而且袁世凯没有怪罪自己，不仅写信恭贺自己晋升，还送了一万两白银，这样的气量实在令人敬服；不过段祺瑞转念一想，人不为己，天诛地灭，做巡抚的机会可不多，自己无论如何也不能放过，而且慰帅胸襟开阔，也能够理解自已的苦衷